เนื้อเรื่องมีฉากในเมืองเอะโดะ (คือโตเกียวในปัจจุบัน เอะโดะเปลี่ยนชื่อเป็นโตเกียวในปี พ.ศ. 2405) ประเทศญี่ปุ่น ในยุคเอโดะยุคที่มนุษย์ต่างดาวที่เรียกกันว่า ชาวสวรรค์ ได้มาตั้งรกรากบนโลกมนุษย์ ชาวสวรรค์ได้ออกคำสั่งริบยศถาบรรดาศักดิ์และยึดดาบของซามูไรไป ทำให้ยุครุ่งเรืองของซามูไรได้จบสิ้นลง ชาวสวรรค์ได้มีอำนาจเหนือเอโดะมากยิ่งขึ้น แต่ยังมีคนหนึ่งที่ยังยึดมั่นในจิตวิญญาณของซามูไร เขาชื่อ ซากาตะ กินโทกิ เคยเป็นนักรบซามูไรต่อต้านชาวสวรรค์ ปัจจุบันเปิดร้านรับจ้างสารพัด มีผู้ช่วยคือ ชิมูระ ชินปาจิหนุ่มแว่นที่ทำงานเพื่อเรียนรู้จิตวิญญาณของซามูไร และคางุระ เด็กหญิงชาวสวรรค์เผ่ายาโตะ ทั้งสามทำงานรับจ้างเพื่อหาเงินมาจ่ายค่าเช่าบ้านและเลี้ยงชีวิตในยุคมืดของซามูไร
นอกจากเรื่องราวการทำงานรับจ้างต่างๆ กินโทกิและลูกน้องยังได้รู้จักกับกลุ่มตำรวจพิเศษติดอาวุธชินเซ็นงุมิ บางครั้งทั้งสองฝ่ายจะทะเลาะกัน บางครั้งจะช่วยเหลือซึ่งกันและกัน เรื่องราวของพวกเขายังมีผู้เกี่ยวข้องอีกหลายคน เช่น คาซึระ โคทาโร่ นักรบขับไล่ต่างแดนซึ่งเป็นเพื่อนของกินโทกิและเป็นอาชญากรมีประกาศจับ ซารุโทบิ อายาเมะ นินจาสาวสายตาสั้นที่หลงรักกินโทกิ เป็นต้น ส่วนตัวละครตัวร้ายของเรื่องคือทากาสุงิ ชินสุเกะ หัวหน้ากลุ่มนักรบขับไล่ต่างแดนที่มีชื่อกลุ่มว่ากองทหารอสุรา เขาเป็นนักรบขับไล่ต่างแดนที่มีหัวรุนแรงกว่าคาซึระ และต้องการจะทำลายเอโดะให้ราบคาบ
หนังสือการ์ตูนกินทามะที่ตีพิมพ์แล้วในประเทศไทย 39 เล่ม มีชื่อปกบนแต่ละเล่มดังนี้
- คนดีมักเป็นคนผมหยักศกตามธรรมชาติ
- ความมานะบากบั่นและความดื้อด้านต่างกันเพียงกระดาษกั้น
- มาลองคิดดูแล้ว ชีวิตคนเราหลังจากกลายเป็นคุณลุงเนี่ยมันนานกว่าตอนหนุ่มไม่ใช่เรอะ!! น่ากลั๊ว น่ากลัว
- คนเป็นพ่อลูกมักเกลียดอะไรเหมือนๆ กัน
- ระวังสายพานให้ดี
- มีสิ่งที่ดาบฟาดฟันไม่ได้อยู่
- เรื่องไร้สาระเนี่ยจำกันแม่นซะจริง
- แฟนของลูกสาวต้องเขกซักโป๊ก
- ถ้าริจะเที่ยวคาบาเร่ต์อายุจะต้องถึง 20 ขวบก่อนนะ
- แมลงตัวเล็กๆ ก็มีจิตวิญญาณเหมือนกัน
- อาทิตย์ยังทอแสง
- ถ้าเร่งนักก็วิ่งเข้า
- ศัตรูเมื่อวาน วันนี้ก็ยังเป็นศัตรูเหมือนเดิม
- เมื่อสี่คนเรียงหน้า จะเกิดเชาว์ปัญญามากมาย
- รอยยิ้มคือการตกแต่งใบหน้าที่ดีที่สุดของผู้หญิง
- ผู้หญิงที่พูดว่าระหว่างฉันกับงานอันไหนสำคัญกว่ากัน ต้องโดนท่าเยอรมันซูเพล็กซ์
- ควรเล่นเกมส์แค่วันละหนึ่งชั่วโมง
- เหล่าบุรุษทั้งหลายจงเป็นลูกผู้ชายที่ไม่ยอมแพ้
- นักวางแผนมักตกหลุมพราง
- ก่อนหน้าจะเข้าสู่ช่วงหยุด ฤดูร้อนเป็นช่วงเวลาที่สนุกที่สุด
- แม้สะโพกจะบิดเบี้ยว แต่ก็จะเดินเป็นเส้นตรง
- คนเรามักมีแรงผลักดันอยู่ที่หัวใจเสมอ...
- เมื่อถึงที่หมายในการไปเที่ยว มักมีเรื่องให้ทะเลาะกัน
- มีบางเรื่องที่แม้นพบกันแล้วก็ไม่อาจจะเข้าใจ...
- หนังสือที่ใช้หน้าคู่เยอะๆเนี่ยเหมือนหนังสือการ์ตูนเลยเนอะ
- การดื่มเหล้าตอนกลางวันจะได้รสชาติที่แตกต่างไป
- สวรรค์ไม่ได้สร้างสรรค์ยอดคน แต่เป็นผู้ประดิษฐ์ทรงผม
- ยามเข้าไปในร้านแผงลอยจะพบความกล้าที่แสนบอบบาง
- แมงมุมยามราตรีมักไม่น่าอภิรมย์
- ความยิ่งใหญ่ของวงหัวนมกับความยิ่งใหญ่ของมนุษย์ถือเป็นความสัมพันธ์ที่ผกผันของซึ่งกันและกัน
- การลงคะแนนวัดความนิยมน่ะเรอะ ก็แค่เรื่องไม่เป็นเรื่อง
- แมวเถื่อนแห่งคาบุกิโจคือเพลงช้าแต่ก็มีจังหวะหนักแน่น...
- ไม่ว่าใครก็อยากแข็งแกร่งและงดงามในหนึ่งเดียว
- ในเมืองที่ไร้ขื่อแป มักมีแต่พวกเฮฮาไปวันๆ มารวมตัวกัน
- เป็นเกียรติที่ได้พบและรู้จัก
- อายุขัยไร้กำหนด
- เมื่อหมดช่วงหยุดพักฤดูร้อน เราจะมองเห็นทุกคนเป็นผู้ใหญ่ขึ้นมานิดหนึ่ง
- เรื่องราวในครอบครัวของคุณลุง มักเป็นเรื่องที่ชวนให้เพลียหัวใจ
- ถึงจะเป็นงานเฮฮาส่งท้ายปี แต่ก็ไม่ควรเฮมากเดี๋ยวจะฮาไม่ออก
